要想提高沼氣池的產氣率，管理是關鍵，要做到科學管理，但是管理要講求方法，切勿盲目管理。管理沼氣池要注意一下幾個方面：
        1、進料出料要勤
        在常溫下，我們加入沼氣池中的料在發酵中很容易被微生物分解消化，其周期大約為80～120天，所進原料會分解殆盡，特別是人畜糞便，分解時間更短，但是原料的產氣時間只有60～80天，所以需要經常加入新鮮原料以保證常年的產氣量旺盛、均衡。在一個8～10平方米的沼氣池內，放入人、畜糞便20公斤左右就可以滿足產氣需要。經過發酵處理的原料，被微生物分解后的沼渣和沼液是非常優質的有機肥，要把產生出的肥料及時運出，但是要留有相當的沼液來維持新舊更替平穩產氣，同時要根據實際情況來決定是否要全部更換。
        2、勤換料
        一般每星期要小出、進料三至七擔，一個月大出、進料二十至三十擔。一年至少清一次沼氣池。每次清池，應留四分之一發酵液，作為再添新料的發酵母液。出、進料應盡可能做到重量相等，配比相符。
        3、池外堆漚原料
        原料入池前，將草粉碎并浸濕發酵1～2天后，再分層堆放。每層厚約50厘米。兩層之間撒少許石灰或草木灰，潑灑人畜糞尿或污水至濕透為止。最后用塑料封閉，加速腐爛。堆漚時間，按春、夏、秋、冬季分別為12、8、10、20天。
        4、合理配料
發酵原料不同，要因地制宜選料，合理搭配。一般發酵原料的比例是：畜糞30%，人糞10%，原料10%，水50%。
        5、注意裝料方法
        裝料的程序是，先進堆漚過的草料。再從進料口進入人畜糞尿（第一次裝料以裝至全池容量的四分之三為宜），最后加水。加水前，應打開活動蓋和導氣管開關，加水速度宜慢不宜快，以防漲壞池體。最后要嚴格做好池子的密封工作。
        6、要勤攪拌
        攪拌池內發酵原料，可促進甲烷菌和營養物質分布均勻，使沼氣池中的細菌和進池原料充分接觸，增加接觸面，主要是為了防止結殼現象產生。攪拌的方法有液體攪拌、氣體攪拌、機械攪拌等幾種形式。農村中一般可采用液體攪拌和人工簡易攪拌法。即從出料口取出料液，再從進料口沖入，或用竹竿、長柄器具直接從進料口伸入池內攪拌。容積較大的沼氣池，應考慮安裝攪拌器。
        7、常檢查
要經常檢查輸氣系統有無漏氣，沼氣池運轉有無故障，以及沼氣池管道特別是管道接頭要進行全面檢查。